[연말정산자료입력] > 정산자료입력 탭에서

① 감면소득 금액란 더블클릭 

② 팝업 창에서 코드도움

③ 감면코드 선택

④ 추가입력에 감면대상 총 급여 입력

⑤ 감면소득에 금액 반영되었는지 확인 

⑥ 중소기업취업자 세액감면 금액 더블클릭

⑦ 팝업 창에서 감면기간 및 감면대상 총 급여액 > 감면대상세액 확인

순서로 작업하시면 됩니다.